Pokémon Center 限量版主机
橙色火稚雞版（日本，2003年4月25日发售）
红色喷火龙版（日本，2004年2月27日发售）
绿色妙蛙花版（日本，2004年2月27日发售）
绿色烈空座版（日本，2004年9月16日发售）
黄色皮卡丘版（日本，2005年3月5日发售）
Pokémon Center（纽约）限量版主机
蓝色盖欧卡版（北美，2003年12月11日发售）（捆绑游戏）
红色固拉多版（北美，2003年12月11日发售）（捆绑游戏）
相关游戏限量版主机
珍珠白 《最终幻想战略版Advance》限量版（日本，2003年1月14日发售）
红黑色搭配 《我们的太阳》限量版（日本，2003年7月17日发售）
淡蓝色 《新约·圣剑传说》玛娜限量版（日本，2003年8月29日发售）
金色 《黄金的太阳》限量版（日本，2003年10月9日发售）
红色 《SD高达G世代Advance》夏亚限量版（日本，2003年11月27日发售）
蓝色 《洛克人EXE 4》洛克人限量版（日本，2003年12月12日发售）
黄色 《超级大金刚2》大金刚限量版（日本，2004年7月1日发售）
橙红色 《火影忍者RPG：继承火焰的意志》鸣人限量版（日本，2004年7月22日发售）
橙黄色搭配 《银河战士：零点任务》限量版（北美，2004年8月10日发售）
深银色 《王国之心：记忆之链》限量版（日本，2004年11月11日发售）
黄色 《塞尔达传说：不可思议的帽子》黄金三角限量版（欧洲，2004年11月12日发售）
红白色搭配 《马里奥 VS. 大金刚》马里奥限量版（欧洲，2004年11月16日发售）
浅绿色 《DONKEY KONG COUNTRY》限量版（北美）
其他限量版主机
火焰加州红限定版（美国，纪念GBA SP北美销量过百万）
“ALL BLACK”新西兰英式橄榄球队限量版（新西兰、澳大利亚，纪念球队闯入世界杯）
Rip Curl限量版（澳大利亚，2004年Rip Curl世界职业冲浪比赛）
经典FC限量版（日本、中国，纪念FC发售20周年）
经典NES限量版（美国，纪念NES发售20周年）
部落刺青限量版（欧洲，刺青艺术家Mister Cartoon设计）
“Who are you?”限量版（美国）
“咸蛋超人”特别版（捷运食品有限公司2005年以换领方法推出，只限亚洲地区）
女孩版（西班牙）
小神游马力欧限量版（中国，纪念《超级马里奥兄弟》发售20周年）
小神游中国龙限量版（中国，随机附赠《超级马力欧》和《瓦力欧大陆》）
小神游密特罗德限量版（中国）
小神游丙戌狗限量版（中国）